内蒙古自然人电子税务局扣缴端上的各种税务管理功能，都是专门为内蒙古当地的居民用户准备的。能够实时根据用户在登录平台时绑定的个人身份信息情况，为用户显示近期所有的税款缴费记录。
人员信息采集：根据《个人所得税基础信息表(A表)》的要求采集相关信息，系统采用先报送人员信息再填写报表的方式。
报送及获取反馈：将人员信息报送后，税务局系统对人员身份信息进行验证并反馈验证结果。
报表填写：扣缴申报包括《综合所得预扣预缴申报》、《分类所得代扣代缴申报》、《非居民代扣代缴申报》、《限售股转让所得扣缴申报》四类申报表;经营所得申报包括《预缴纳税申报》(个人所得税经营所得纳税申报表(A表))、《年度汇缴申报》(个人所得税经营所得纳税申报表(B表))。
申报表报送：通过网络方式将填写完整的申报表发送至税务机关并获取申报反馈结果。
税款缴纳：申报成功后通过网上缴款或其他方式缴纳税款。
税款所属月份：默认为系统当前时间的上月。例如：当前时间为2019年8月1日，则[税款所属月份]为2019年7月。可点击下拉键，切换[税款所属月份]。
常用功能区：系统常用功能统一放在该处，点击快捷按钮进入功能页面。
待处理事项区：显示消息类型为冒用行为检举且状态是未处理的消息。
左边菜单树：通过点击功能菜单打开对应功能模块。
1.本程序是专门用于个人所得税代扣代缴(预扣预缴)申报的客户端软件。其中“自然人电子税务局(扣缴端完整安装包)”适用于没有安装过本系统的电脑安装。“自然人电子税务局(扣缴端手工升级包)”适用于安装了自然人电子税务局(扣缴端)并且版本低于上述版本又无法自动完成在线升级的电脑进行升级安装。
2.支持一台电脑申报多个企业或单位的个人所得税，通过软件右上角“单位管理”菜单添加多个企业或多个扣缴单位切换申报。
3.初次使用的设置为：纳税人识别号为统一社会信用代码，扣缴义务人名称为单位全称。如果统一社会信用代码证号或扣缴义务人名称不符，请联系主管税务机关获取。
4.在软件中，单位员工离职的，在软件的“人员信息采集”中设置纳税人状态为“非正常”，并且填写离职日期。
5.具有扣缴税款功能。扣缴税款前需签约财税库银横向联网系统或用网上银行缴款，如果没有签约，使用“自然人电子税务局(扣缴端)”申报后，可到办税大厅现金缴款。没有税款的，无需缴款。
6.扣缴义务人第一次申报，需到办税大厅获取初始申报密码或登录“个人所得税”手机APP设置申报密码。如果更换电脑或重新安装系统，申报密码为上次成功申报的密码。初次设置申报密码或忘记申报密码的可以用法定代表人或财务负责人的身份证号码使用“个人所得税”手机APP重置申报密码，或到办税服务厅(自然人税收管理系统-申报-代扣代缴申报-个税代扣代缴申报密码发放(ITS))进行重置。
7.个体工商户、个人独资企业和合伙企业可以在“自然人电子税务局(扣缴端)”申报投资者的经营所得个人所得税。
8.提供有扣缴个人所得税报告表查询功能，需要打印申报表的，请查询后导出申报表在excel中打印，也可以导出申报表在电脑中保存。
9.扣缴义务人因更换电脑需重新安装系统的，请在“自然人电子税务局(扣缴端)”的“系统设置”备份个税代扣代缴数据，之后将备份文件复制到新电脑恢复。
10.建议安装在除C盘以外的硬盘，安装完后要用实名办税或申报密码登录系统。2019年11月9日上线实名登录功能，过渡期内原申报密码登录方式继续有效。
内蒙古自然人电子税务局扣缴端配备有专门的显示税款缴费窗口，有效地帮助内蒙古居民解决了线下缴费补税不便的问题。直接就能通过线上银行卡绑定的方式完成一键付款操作，并且税务缴费的每一笔订单，都是能够实时查看电子发票信息的。
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