大型企业(公司)综合档案管理系统会实时根据绑定的企业信息，将内部数据档案进行智能化的分类摆放。便于企业管理人员可以随时通过关键词筛选的方式，找到自己需要的档案资料进行浏览。
(1)目录管理
目录管理中最基本、最常用的分类管理方法，包括目录元数据信息管理、用户访问目录权限设置和目录库存维护等。
(2)信息统计
信息统计的功能主要是对文件管理中最基本的数据进行无用分类总结，要求信息统计在一定时间内完成。
3)系统帮助模块
在本功能模块中，该模块不仅可以指导用户使用手册，指导用户正确使用文件管理系统，还可以提供文件管理工作的相关知识，用户可以在此检查，包括电子文件标准格式示例、标准文件主题索引规则、标准文件描述规则、科技文件组合一般要求等。
(4)文件收集整理
文件信息的采集和整理是档案信息管理的基础工作，也是一项重要工作。结合档案信息管理的实际情况，根据档案管理的需要，对档案信息进行采集、输入和排序。
保证档案信息的顺序，是档案信息管理系统的基本功能。通过档案记录和排序功能，实现一次性记录，支持多种档案信息的记录，节约人员时间和精力，提高工作效率。
主要档案分类包含：
科研开发类、项目建设类、设备仪器类、会计业务类
职工管理类、资源勘探开发类、特殊载体类、编研类等;
以上类目包含多个二级类目。
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大型企业(公司)综合档案管理系统上的每一个大分类栏目中，都可以支持多个小分类选项的添加。通过对数据精细化整理的方式，为企业最大限度地确保了档案的储存安全。
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